Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM3Q96MX0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms