Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00479Q96M42 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00479Q96M42 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms