Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNBD2Q96M20 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms