Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms