Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71F1Q96KD3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
FAM71F1Q96KD3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71F1Q96KD3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71F1Q96KD3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71F1Q96KD3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71F1Q96KD3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71F1Q96KD3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71F1Q96KD3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71F1Q96KD3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71F1Q96KD3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71F1Q96KD3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71F1Q96KD3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71F1Q96KD3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71F1Q96KD3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71F1Q96KD3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71F1Q96KD3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM71F1Q96KD3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM71F1Q96KD3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM71F1Q96KD3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM71F1Q96KD3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM71F1Q96KD3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM71F1Q96KD3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM71F1Q96KD3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM71F1Q96KD3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM71F1Q96KD3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms