Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM87BQ96K49 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms