Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG8

MAGED4, Melanoma-associated antigen D4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4Q96JG8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAGED4Q96JG8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MAGED4Q96JG8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms