Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms