Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH5

RPL39L, 60S ribosomal protein L39-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39LQ96EH5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39LQ96EH5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms