Protein–RNA interactions for Protein: Q96DV4

MRPL38, 39S ribosomal protein L38, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL38Q96DV4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL38Q96DV4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL38Q96DV4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL38Q96DV4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MRPL38Q96DV4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL38Q96DV4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL38Q96DV4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL38Q96DV4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL38Q96DV4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL38Q96DV4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL38Q96DV4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL38Q96DV4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL38Q96DV4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL38Q96DV4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL38Q96DV4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL38Q96DV4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL38Q96DV4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL38Q96DV4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL38Q96DV4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL38Q96DV4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL38Q96DV4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL38Q96DV4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL38Q96DV4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL38Q96DV4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms