Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms