Protein–RNA interactions for Protein: Q96CD2

PPCDC, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCDCQ96CD2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PPCDCQ96CD2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPCDCQ96CD2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPCDCQ96CD2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPCDCQ96CD2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPCDCQ96CD2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPCDCQ96CD2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PPCDCQ96CD2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPCDCQ96CD2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PPCDCQ96CD2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPCDCQ96CD2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PPCDCQ96CD2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPCDCQ96CD2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPCDCQ96CD2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPCDCQ96CD2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPCDCQ96CD2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPCDCQ96CD2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPCDCQ96CD2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPCDCQ96CD2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PPCDCQ96CD2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPCDCQ96CD2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPCDCQ96CD2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPCDCQ96CD2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms