Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DHX58Q96C10 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms