Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC74AQ96AQ1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC74AQ96AQ1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms