Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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TRIM63Q969Q1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM63Q969Q1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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