Protein–RNA interactions for Protein: Q92791

P3H4, Endoplasmic reticulum protein SC65, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4Q92791 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
P3H4Q92791 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P3H4Q92791 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
P3H4Q92791 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
P3H4Q92791 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P3H4Q92791 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P3H4Q92791 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P3H4Q92791 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P3H4Q92791 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
P3H4Q92791 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P3H4Q92791 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P3H4Q92791 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
P3H4Q92791 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P3H4Q92791 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P3H4Q92791 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P3H4Q92791 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
P3H4Q92791 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P3H4Q92791 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P3H4Q92791 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P3H4Q92791 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P3H4Q92791 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P3H4Q92791 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P3H4Q92791 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
P3H4Q92791 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
P3H4Q92791 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
P3H4Q92791 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P3H4Q92791 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms