Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms