Protein–RNA interactions for Protein: Q92541

RTF1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTF1Q92541 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTF1Q92541 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTF1Q92541 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTF1Q92541 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTF1Q92541 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTF1Q92541 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTF1Q92541 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTF1Q92541 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTF1Q92541 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTF1Q92541 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RTF1Q92541 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTF1Q92541 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms