Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms