Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASKIN2Q8WXE0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASKIN2Q8WXE0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms