Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCAF4Q8WV16 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms