Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC41.84■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
RB1CC1Q8TDY2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC41.79■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
RB1CC1Q8TDY2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.27
RB1CC1Q8TDY2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC41.76■■■■■ 4.27
RB1CC1Q8TDY2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.27
RB1CC1Q8TDY2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.27
RB1CC1Q8TDY2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC41.76■■■■■ 4.27
RB1CC1Q8TDY2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.27
RB1CC1Q8TDY2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.27
RB1CC1Q8TDY2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
RB1CC1Q8TDY2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
RB1CC1Q8TDY2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC41.75■■■■■ 4.27
RB1CC1Q8TDY2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
RB1CC1Q8TDY2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
RB1CC1Q8TDY2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
RB1CC1Q8TDY2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
RB1CC1Q8TDY2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
RB1CC1Q8TDY2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
RB1CC1Q8TDY2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
RB1CC1Q8TDY2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
RB1CC1Q8TDY2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
RB1CC1Q8TDY2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
RB1CC1Q8TDY2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
RB1CC1Q8TDY2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
RB1CC1Q8TDY2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms