Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms