Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP35Q8NFH5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms