Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMIEQ8NEW7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms