Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDI1

EHBP1, EH domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1Q8NDI1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EHBP1Q8NDI1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EHBP1Q8NDI1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms