Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms