Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms