Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF148Q8N7C7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF148Q8N7C7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF148Q8N7C7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF148Q8N7C7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF148Q8N7C7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF148Q8N7C7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF148Q8N7C7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF148Q8N7C7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF148Q8N7C7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF148Q8N7C7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF148Q8N7C7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF148Q8N7C7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF148Q8N7C7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF148Q8N7C7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF148Q8N7C7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF148Q8N7C7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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RNF148Q8N7C7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF148Q8N7C7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF148Q8N7C7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF148Q8N7C7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF148Q8N7C7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF148Q8N7C7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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RNF148Q8N7C7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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RNF148Q8N7C7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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RNF148Q8N7C7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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RNF148Q8N7C7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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RNF148Q8N7C7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF148Q8N7C7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF148Q8N7C7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF148Q8N7C7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF148Q8N7C7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF148Q8N7C7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF148Q8N7C7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF148Q8N7C7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF148Q8N7C7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF148Q8N7C7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF148Q8N7C7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF148Q8N7C7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF148Q8N7C7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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