Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SVBPQ8N300 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVBPQ8N300 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms