Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNTD2Q8IXW0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms