Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM139Q8IV31 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms