Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms