Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC29A4Q7RTT9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC29A4Q7RTT9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC29A4Q7RTT9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC29A4Q7RTT9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC29A4Q7RTT9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC29A4Q7RTT9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC29A4Q7RTT9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC29A4Q7RTT9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC29A4Q7RTT9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC29A4Q7RTT9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC29A4Q7RTT9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms