Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms