Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTF1AQ7RTS3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms