Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRADAQ7RTN6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRADAQ7RTN6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms