Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAXIP1Q6ZW49 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms