Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KIAA1549LQ6ZVL6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KIAA1549LQ6ZVL6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KIAA1549LQ6ZVL6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KIAA1549LQ6ZVL6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KIAA1549LQ6ZVL6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
KIAA1549LQ6ZVL6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
KIAA1549LQ6ZVL6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KIAA1549LQ6ZVL6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KIAA1549LQ6ZVL6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KIAA1549LQ6ZVL6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1549LQ6ZVL6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1549LQ6ZVL6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1549LQ6ZVL6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1549LQ6ZVL6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1549LQ6ZVL6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1549LQ6ZVL6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1549LQ6ZVL6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1549LQ6ZVL6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1549LQ6ZVL6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1549LQ6ZVL6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1549LQ6ZVL6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1549LQ6ZVL6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1549LQ6ZVL6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms