Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF493Q6ZR52 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms