Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.3 ms