Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms