Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q6P435 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q6P435 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Q6P435 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6P435 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q6P435 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6P435 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6P435 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q6P435 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6P435 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6P435 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q6P435 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q6P435 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P435 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P435 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P435 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P435 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P435 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P435 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P435 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P435 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P435 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P435 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P435 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P435 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P435 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P435 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P435 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P435 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P435 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P435 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P435 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P435 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P435 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P435 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P435 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P435 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P435 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P435 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P435 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P435 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P435 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P435 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P435 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P435 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P435 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P435 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P435 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P435 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P435 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P435 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P435 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P435 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P435 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P435 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P435 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P435 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P435 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P435 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P435 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P435 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P435 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P435 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P435 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P435 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Q6P435 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6P435 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6P435 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6P435 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6P435 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6P435 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6P435 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6P435 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6P435 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms