Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KANK3Q6NY19 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KANK3Q6NY19 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms