Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
H3F3CQ6NXT2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
H3F3CQ6NXT2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms