Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RWDD4Q6NW29 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms