Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REEP3Q6NUK4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
REEP3Q6NUK4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms