Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPECC1LQ69YQ0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms