Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46CQ5VWP2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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