Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms